Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hspg2Q05793 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms