Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms