Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sox10Q04888 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms