Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox8Q04886 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox8Q04886 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox8Q04886 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox8Q04886 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sox8Q04886 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms