Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col6a1Q04857 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms