Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms