Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms