Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddr1Q03146 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms