Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfiaQ02780 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms