Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RykQ01887 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RykQ01887 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RykQ01887 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RykQ01887 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RykQ01887 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RykQ01887 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RykQ01887 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RykQ01887 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RykQ01887 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms