Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd1Q01822 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms