Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms