Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HmgcrQ01237 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms