Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grin2bQ01097 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grin2bQ01097 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms