Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pde1bQ01065 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pde1bQ01065 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pde1bQ01065 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pde1bQ01065 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pde1bQ01065 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pde1bQ01065 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pde1bQ01065 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Pde1bQ01065 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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