Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms