Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms