Protein–RNA interactions for Protein: P97360

Etv6, Transcription factor ETV6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv6P97360 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Etv6P97360 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Etv6P97360 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Etv6P97360 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Etv6P97360 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms