Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ldb1P70662 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb1P70662 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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