Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms