Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RhobP62746 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RhobP62746 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms