Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms