Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Polr2iP60898 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Polr2iP60898 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Polr2iP60898 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Polr2iP60898 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Polr2iP60898 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Polr2iP60898 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Polr2iP60898 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Polr2iP60898 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Polr2iP60898 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Polr2iP60898 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Polr2iP60898 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Polr2iP60898 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Polr2iP60898 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Polr2iP60898 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Polr2iP60898 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms