Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CirbpP60824 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CirbpP60824 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms