Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhbdl3P58873 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms