Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms