Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TdgP56581 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TdgP56581 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TdgP56581 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TdgP56581 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TdgP56581 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TdgP56581 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TdgP56581 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TdgP56581 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TdgP56581 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TdgP56581 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms