Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gp1bbP56400 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms