Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms