Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TspoP50637 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TspoP50637 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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TspoP50637 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TspoP50637 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TspoP50637 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TspoP50637 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TspoP50637 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TspoP50637 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TspoP50637 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TspoP50637 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TspoP50637 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TspoP50637 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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