Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1cP49919 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1cP49919 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkn1cP49919 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms