Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms