Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brca1P48754 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms