Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms