Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mmp9P41245 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Mmp9P41245 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Mmp9P41245 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mmp9P41245 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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