Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VhlP40338 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms