Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddit3P35639 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddit3P35639 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms