Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd22P35329 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd22P35329 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd22P35329 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd22P35329 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms