Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab20P35295 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms