Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp4P35123 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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