Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifnar1P33896 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms