Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc10P31257 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms