Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd2P30280 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd2P30280 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms