Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NapbP28663 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NapbP28663 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms