Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pde6aP27664 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6aP27664 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms