Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd12P23812 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms