Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms