Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3P21107 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3P21107 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms