Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a2P20490 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms