Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TP20293 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TP20293 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TP20293 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TP20293 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TP20293 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TP20293 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TP20293 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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